东吴学院党委下设大学计算机系党支部、大学物理系党支部、大学数学系党支部、大学外语系第一党支部、大学外语系第二党支部、公共体育系党支部、公共化学系党支部、行政党支部、退休党支部9个党支部，现有教职工党员136人。